南京大學現代生物研究院 韓瑞琦課題組 博士后招聘 研究院簡介 南京大學現代生物研究院，簡稱"現代生物院"(Institute of Modern Biology, Nanjing University; IMB)，成立于2020年7月，位于六朝古都南京?，F代生物院聚焦于創新型生物醫學前沿基礎研究，鼓勵和支持開拓性、系統性的科學探索，致力成為擁有一批國際公認學術權威和"學者型研究環境"的國際一流生物醫學研究中心。 實驗室課題組簡介 韓瑞琦教授，2007-2011年在荷蘭奈梅亨獲得生命科學本科學位，隨后于2011-2013年在荷蘭阿姆斯特丹攻讀癌癥學碩士。2013年加入荷蘭癌癥研究所Reuven Agami院士團隊從事基因轉錄調控與蛋白質翻譯效率之間系統性關聯的博士研究，在此期間首次開發了針對非編碼基因組及增強子的CRISPR篩選方法。2019年加入荷蘭皇家科學院發育生物學與干細胞研究所從事三維基因組調控及黏連蛋白相關的博士后研究。其研究成果發表于Cell， Nature biotechnology，Molecular cell，Genome biology等國際期刊。 2025年加盟南京大學現代生物研究院，建立基因組結構調控實驗室。 韓瑞琦教授長期致力于探究表觀遺傳對基因轉錄及細胞功能的影響。在相關領域取得了一系列原創性成果。1. 首次通過系統性的研究來揭示在細胞中基因轉錄過程與蛋白質翻譯效率之間的直接關系，并通過m6A相關的RNA修飾來解釋了其中的關鍵機制（Cell, 2017）。2. 建立了首個針對非編碼基因組的CRISPR文庫來對人類基因組的增強子區域進行功能性篩選，并發現了數個具有顯著細胞功能的增強子 （Nature biotechnology, 2016; Genome biology 2018）。3. 首次在細胞中開發了黏連蛋白定向裝載并可實現正常蛋白功能的工具，同時揭示了若干黏連蛋白關鍵功能的原創研究 （Manuscript in revision, 2023）。 代表性論文 1. Ruiqi Han#*, Yike Huang#, Iwan Vaandrager, Amin Allahyar, Mikhail Magnitov, Marjon Verstegen, Elzo de Wit, Peter H. L. Krijger, Wouter de Laat*. Targeted cohesin loading characterizes the entry and exit sites of loop extrusion trajectories. (Manuscript in revision) 2. Boris Slobodin#*, Ruiqi Han#, Vittorio Calderone, Joachim AF Oude Vrielink, Fabricio Loayza-Puch, Ran Elkon, Reuven Agami*. Transcription impacts the efficiency of mRNA translation via co-transcriptional N6-adenosine methylation. Cell 169(2): 326-337. (2017) 3. Ruiqi Han#, Li Li#, Alejandro Pi?eiro Ugalde, Arieh Tal, Zohar Manber, Eric Pinto Barbera, Veronica Della Chiara, Ran Elkon, Reuven Agami. Functional CRISPR screen identifies AP1-associated enhancer regulating FOXF1 to modulate oncogene-induced senescence. Genome biology 19: 118. (2018) 4. Gozde Korkmaz#, Rui Lopes#, Alejandro P Ugalde, Ekaterina Nevedomskaya, Ruiqi Han, Ksenia Myacheva, Wilbert Zwart, Ran Elkon, Reuven Agami*. Functional genetic screens for enhancer elements in the human genome using CRISPR-Cas9. Nature Biotechnology 34(2): 192-198. (2016) 5. Niels J. Rinzema, Konstantinos Sofiadis, Sjoerd J. D. Tjalsma, Marjon J. A. M. Verstegen, Yuva Oz, Christian Valdes-Quezada, Anna-Karina Felder, Teodora Filipovska, Stefan van der Elst, Zaria de Andrade dos Ramos, Ruiqi Han, Peter H. L. Krijger, Wouter de Laat*. Building regulatory landscapes reveals that an enhancer can recruit cohesin to create contact domains, engage CTCF sites and activate distant genes. Nature Structural & Molecular Biology 29(6): 563-574. (2022) 6. Li Li, Alejandro P Ugalde, Colinda LGJ Scheele, Sebastian M Dieter, Remco Nagel, Jin Ma, Abhijeet Pataskar, Gozde Korkmaz, Ran Elkon, Miao-Ping Chien, Li You, Pin-Rui Su, Onno B Bleijerveld, Maarten Altelaar, Lyubomir Momchev, Zohar Manber, Ruiqi Han, Pieter C Van Breugel, Rui Lopes, Peter Ten Dijke, Jacco van Rheenen, Reuven Agami*. A comprehensive enhancer screen identifies TRAM2 as a key and novel mediator of YAP oncogenesis. Genome biology 22(1): 1-28. (2021) 7. Boris Slobodin, Anat Bahat, Urmila Sehrawat, Shirly Becker-Herman, Binyamin Zuckerman, Amanda N. Weiss, Ruiqi Han, Ran Elkon, Reuven Agami, Igor Ulitsky, Idit Shachar, Rivka Dikstein*. Transcription Dynamics Regulate Poly(A) Tails and Expression of the RNA Degradation Machinery to Balance mRNA Levels. Molecular Cell 78(3):434-444. (2020) 8. Li Li, Pieter C van Breugel, Fabricio Loayza-Puch, Alejandro P Ugalde, Gozde Korkmaz, Naama Messika-Gold, Ruiqi Han, Rui Lopes, Eric P Barbera, Hans Teunissen, Elzo de Wit, Ricardo J Soares, Boye S Nielsen, Kim Holmstr?m, Dannys J Martínez-Herrera, Maite Huarte, Annita Louloupi, Jarno Drost, Ran Elkon, Reuven Agami*. LncRNA-OIS1 regulates DPP4 activation to modulate senescence induced by RAS. Nucleic Acids Research gky087, https://doi.org/10.1093/nar/gky087. (2018) 9. Jianhui Sun, Remco Nagel, Esther A Zaal, Alejandro Pi?eiro Ugalde, Ruiqi Han, Natalie Proost, Ji-Ying Song, Abhijeet Pataskar, Artur Burylo, Haigen Fu, Gerrit J Poelarends, Marieke van de Ven, Olaf van Tellingen, Celia R Berkers & Reuven Agami*. SLC1A3 contributes to L-asparaginase resistance in solid tumors. The EMBO Journal 38(21). (2019) 10. Ruiqi Han, Boris Slobodin, Reuven Agami. The Methylated way to translation. Oncotarget 8(55): 93313-14. (2017) 11.Florie Borel, Ruiqi Han, Allerdien Visser, Harald Petry, Sander J.H. van Deventer, Peter L.M. Jansen, Pavlina Konstantinova, with collaboration of the Réseau Centre de Ressources Biologiques Foie (French Liver Biobanks Network), France. Adenosine triphosphate‐binding cassette transporter genes up‐regulation in untreated hepatocellular carcinoma is mediated by cellular microRNAs. Hepatology 55: 821–832. doi:10.1002/hep.24682. (2012) 招聘崗位：博士后科研人員 一、崗位要求 1、博士后應聘者應在表觀遺傳研究方向，分子細胞生物學等相關領域已取得或即將取得博士學位，具有表觀遺傳學等研究背景；博士期間受過良好的科研訓練，以第一作者身份在國際重要刊物上發表領域內有影響力的論文。 2、有科研熱情，具有獨立開展科研課題的能力和良好的實驗操作能力；具有較好的英文閱讀和寫作能力； 3、具有獨立申請基金的能力，并參與實驗室的項目申請； 4、善于交流和溝通，富有團隊合作精神。 二、崗位待遇 1、工資待遇：有競爭力的年薪，積極支持并推薦申請各種基金與博士后項目，特別優秀者一事一議；優先支持申報南京大學2025年度“毓秀青年學者計劃”，入選者年收入可達30萬以上。 2、所聘人員的人事、工資、保險、福利等參照國家對事業單位的相關規定，以及南京大學的相關規章制度執行； 3、博后/專職科研系列公寓，住房補貼； 4、享受學校同等職工福利待遇。 三、申請方式 請應聘者將個人簡歷，簡要的未來研究計劃或方向，發表的文章及相關學歷學位證明材料等合并成一個PDF文件形式發送至***************。格式"姓名-博士后申請"。另請至少提供兩封推薦信（≥2），由推薦人直接投遞至***************。應聘材料將予以嚴格保密，不予退還。通過初審者，我們會盡快安排面試。期待您的加盟！